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生物信息学研讨系列
转录组&R语言绘图技能研讨班

   

应广大学员需求,华大基因学院集结转录组分析、R语言绘图领域专家,将华大在各项目执行过程中所积累的宝贵经验,沉淀为经典课程呈现给各位同仁。

 

主办单位:深圳市华大基因学院
举办地点:中国 深圳
培训时间:2017年6月19日(周一)——2017年6月23日(周五)

【培训目标】 

• 了解转录组学最新进展,主流前沿研究思路;

• 掌握转录组常用分析软件的使用方法和分析要点;

• 转录组项目设计和执行过程中遇到的实际问题,加快成果转化;

• 用R掌握常规数据处理、统计分析方法;

• 提供有针对性的R绘图指导、能够运用R绘图工具实现发表文章所需图形的绘制。

 

【培训优势

满足你的独立动手能力、独立解决问题能力,让你学会如何将所学知识应用到实际研究中,学习到书本知识与实际应用中的差异,从而了解并获得更多的项目经验。

华大基因为学员提供了windows系统能用的分析软件,推荐学员自备电脑。

【培训特色】
• 一流的讲师团队——丰富的软件研发经验、重大项目执行经验
• 全面的课程——技术原理、分析流程、技术应用相互结合
• 实用软件——从工作中的实际需要出发,精心挑选相应软件上机实操
• VIP增值服务——培训后期赠送R语言绘图在线学习课程
• 面对面解决问题——与专家面对面探讨项目中的瓶颈问题

【课程安排

【注】:深圳华大基因学院保留对以上课程信息(包括主题、课程安排和其他细节)进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准。

【绘图例】


 

 

【讲师团队】

我们的讲师来自工作一线,项目经验丰富,多次参与重大项目和论文撰写,有开发生物信息学软件的宝贵实战经验,对生物信息学有全面了解和深刻认识。每个专题主讲一人,老师配备助教,同时指导项目讨论及辅导实践上机。

华大基因学院专职讲师,培训经验丰富,责任心强,讲解细致,举一反三。

王崇志:华大高级生物信息工程师,有6年专业工作经验,主要从事侧重统计分析与软件开发的生物信息技术研发与应用工作。先后参与了复杂基因组组装软件开发、只过滤流程自动化、人外显子CNV检测软件开发等研发项目和烟草、麻竹、肉牛等基因组项目及若干转录组、甲基化等项目。

1.  Yu Wang1,2§*, Wei Li, Yingying Xia2,5§, Chongzhi Wang,Y. Tom Tang2,4§,et al, Identifying Human Genome-wide CNV, LOH and UPD by Targeted Sequencing of Selected Regions PLoS one April 28 2015 DOI: 10.1371/journal.pone.0123081

2.  Longbiao Guo,Jie Qiu,Zujing Han,Zihong Ye,Chao Chen,Chuanjun Liu,Xiufang Xin,Chu-Yu Ye,Ying-Ying Wang,Hongqing Xie,Yu Wang,Jiandong Bao,She Tang,Jie Xu,Yijie Gui,Fei Fu,Weidi Wang,Xingchen Zhang,Qianhua Zhu,Xuanmin Guang,Chongzhi Wang,Haifeng Cui,Daguang Cai,Song Ge,Gerald A. Tuskan,Xiaohan Yang,Qian Qian,Sheng Yang He,Jun Wang,Xue-Ping Zhou,Longjiang Fan, A host plant genome (Zizania latifolia) after a century-long endophyte infection,The Plant Journal: 7 July 2015 DOI: 10.1111/tpj.12912 PMID:26072920

3.  Chugang Mei, Hongcheng Wang,Wenjuan Zhu, Hongbao Wang, Gong Cheng, Kaixing Qu, Xuanmin Guang, Anning Li,Chunping Zhao, Wucai Yang, Chongzhi Wang,Yaping Xin & Linsen Zan, Whole-genome sequencing of the endangered bovine species Gayal (Bos frontalis) provides new insights into its genetic features,Scientific Reports 6, 19787 (2016).doi:10.1038/srep19787

袁永娴:华大RNA方向研发负责人从事生物信息分析5年,主要从事转录组,RNA-Seq,lncRNA,单细胞等流程的搭建与维护,以及HiSeq,PacBio,BGISEQ-500,Ion Proton等测序平台的评估与应用。 

1. Yuan Y, Xu H, Leung R K K. An optimized protocol for generation and analysis of Ion Proton sequencing reads for RNA-Seq[J]. BMC genomics, 2016, 17(1): 1.

2. Mou L, Zhang Q, Wang Y, et al. Identification of Ube2b as a novel target of androgen receptor in mouse sertolicells[J]. Biology of reproduction,2013: biolreprod. 112.103648.


石明明:泛亚太疾病研究部,疾病研究方向。  

1.SJ Zhang#, CJ Liu#, Mingming Shi#, L Kong, JY Chen, WZ Zhou, X Zhu, P Yu, J Wang, XZ Yang, N Hou, ZQ Ye, R Zhang, R Xiao, X Zhang* and Chuan-Yun Li*, RhesusBase: a Knowledgebase for the Monkey Research Community, Nucleic Acids Research, 2012

2.Zeng J, Liu Y, Liu W, Liu X, Liu F, Huang P, Zhu P, Chen J, Shi M, Guo F, Cheng P, Zeng J, Liao Y, Gong J, Zhang HM, Wang D, Guo AY, Xiong X. Integration of transcriptome, proteome and metabolism data reveals the alkaloids biosynthesis in Macleaya cordata and Macleaya microcarpa, PLoS One, 2013

3.JY Chen, Z Peng, R Zhang, XZ Yang,Bertrand CM Tan, CJ Liu, Y E. Zhang, Mingming Shi, ZQ Ye, X Zhang* and Chuan-Yun Li*, Functional RNA Editome in Rhesus Macaque Shaped by Adenosine Deamination and Purifying Selection, PLoS Genetics, 2014


朱欠华:高级项目负责人,从事生物信息分析6年,主要擅于转录组和重测序分析,包括表达定量、非编码RNA调控、基因共表达网络以及变异检测等。参与多个合作项目(部分文章已发表),主要负责其中的信息分析工作。

1.Hao Q, Yadav R, …,Zhu Q, et al. Transcriptome profiling of brown adipose tissue during cold  exposure  reveals extensive regulation of glucose metabolism. Am J Physiol Endocrinol Metab. 2015 Mar 1;308(5):E380-92

2.Guo L, Qiu J, …, Zhu Q, et al. A host plant genome (Zizania latifolia) after a century long endophyte infection. Plant J. 2015 Aug;83(4):600-9 Mol Biosyst. 2015 Nov 10;11(12):3253-63

【招生对象】

• 从事生命科学、农学、医学等领域科研工作者和高校教师及研究生;
• 迫切希望提升
转录组生物信息分析能力&R绘图技能的学者。

注册费

6600/人,包括学费、资料费、上机费、其他材料费。

【优惠政策】

• 凡华大基因长期业务合作伙伴和华大基因生物信息学培训班老学员,单选课程可享受9.5折优惠 ;
• 4+1团体优惠,即同一单位有4人同时报名参加该期培训班,可额外免费赠送1个名额(只限于同一期培训班) 。
(以上优惠政策不能同时享用)

【注意事项】

请您在开班前将您的详细培训需求反馈给我们,以保证本次培训能更好的满足您的需求。

请您携带自己的手提电脑,以便能将相关软件拷回使用。
• 本次课程限定名额35名,为确保培训资源得到最佳利用,请尽快申请报名参加。
• 已经成功付款的学员,如在2017年6月10日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3 个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。
• 撤销席位后,学员可提交延期申请,参加 2017 年9月- 2018 年9月期间由深圳市华大基因学院举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担。

【报名方式】

1、网上报名:点击报名链接(https://www.wenjuan.com/s/E3EbYf/),填写个人资料,提交;

2、咨询电话:0755-36352044 (对外培训 9:00-12:00  14:00-18:00

3、联系邮箱:training@service.genomics.cn。