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生物信息学培训系列│基因组学前沿技术专题培训班


地点:深圳    时间:2017.3.20—2017.3.24


        

        华大基因精心设计了具有最前沿性、实用性和针对性的生物信息学理论和实操课程。目前“基因组学前沿技术专题培训班”已举办39期,学员来自全国30余个省市,累计培训学员1130余名,其中不乏教授、博导。同时,本培训班还特别受博士后、硕博生等年轻学者的青睐,不少学员通过本培训建立了长期协作关系,共同申请国家973、863课题,共同发表论文。

        培训班专门为学员提供windows系统能用的分析软件,请学员自带笔记本电脑。(电脑需要连接有线网络端口,CPU 2G以上,内存4G以上,推荐使用 Google chrome浏览器联网操作)


【课程特点】

  • 《科学》、《自然》经典文章作者参与授课,传递华大所掌握的最新前沿信息;
  • 结合华大各大项目实践经验,详细介绍开源数据库、组装、注释、重测序分析软件的使用方法;
  • 华大经典项目总体设计思路、遇到的困难及解决方案;
  • BGI Online 平台demo演练,案例应用流程分析实操;
  • 赠送服务:每位学员享用BGI Online充值代金卷。


主办单位:深圳市华大基因学院 

举办地点:中国 深圳 

培训时间:2017年3月20日——2017年3月24日




时间

课程

形式

时长

收费

第一天

1、基因组学生物信息学前沿技术动态

理论

3h

6800/

2、常用核酸序列数据库、常用数据格式介绍与应用

常用生物信息公共数据库资源,数据批量下载以及常用工具应用(KEGG, GO, NCBI ,DAVID, Ensemble, uniprot

实操

4h

第二天

3Linux操作基础

理论

+

大型机

3h

ALinux操作系统常用文件操作

BLinux操作系统常用目录操作

CVi编辑器的使用

DLinux操作系统安装软件

4、基因组de novo 组装方法与软件

理论+大型机

4h

第三天

5、基因组注释和基因注释

理论

+

大型机

7h

A、基因组注释的方法,重复序列注释 、基因预测、基因功能注释、非编码RNA基因注释、其它功能原件注释

B、上机与实操 RepeatMasker GenescanGenewise InterproScantRNAScan-SE

第四天

6、基因组重测序及数据分析

理论

+

大型机

7h

A、数据模拟

B、数据过滤及质量评估

CSOAP/Bwa/Bowtie等软件的使用

D、利用变异分析群体

第五天

7、基因数据分析的过去、现在与未来

理论

3h

A 云计算概要

B 生物云计算市场现状与潜力

C IT+BT时代

D BGI Online发展历程与展望

8BGI Online支持科研应用案例实操演练、大数据挖掘分析

理论

+

实操

4h

A、平台使用介绍:基础功能和产品服务

BBGI Online支持科研应用整体介绍及经典案例分享:基因表达定量(RNAseq quantification)应用介绍;全基因组测序(WGS)应用介绍(hadoopMaxCompute);全外显子组测序(WES)应用介绍

【注】:深圳华大基因学院保留对以上课程信息(包括主题、课程安排和其他细节)进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准。


【讲师团队】

各专题学科带头人、《nature》《science》作者亲自授课。 


【培训特色】 

  • 培训宗旨——尽华大所能,全力为您打造您所需要的课程,最大可能的满足您的需求 
  • 一流的讲师团队——丰富的软件研发经验、重大项目执行经验 
  • 理论课与实践课相结合,讲师与学员研讨的方式进行 
  • 精心挑选相应的上机软件,为每位学员提供实际操作的机会 
  • 课下主讲老师为您所遇到的瓶颈问题提供个性化解答 
  • 为保证培训效果及培训质量,每期班的课程人数不超过35人。资源有限,欲报从速。 

【收费标准】 
  • 注册费:6800元/人,含学费、资料费、上机费、餐费等; 
  • 培训期间协助安排住宿,住宿费用自理。 


【优惠政策】 

  • 凡华大基因生物信息学培训班老学员和华大基因长期业务合作伙伴,可享受9.5折优惠。 
  • 4+1团体优惠,即同一单位有5人同时报名参加该期培训班,其中1人可享受免费赠送的名额(只限于同一期培训班)。 

(以上两项优惠不能同时使用,最终优惠解释权归华大基因所有!) 


【课程对象】 
1、从事生命科学、医学、农学等领域科研工作者和高校教师及研究生 
2、具备生物信息学基础的学者 


【讲师简介】 
金鑫:华大基因大数据研究科学家,参与并领导一系列重大科研项目如千人基因组计划、中丹糖尿病(LUCAMP),自闭症项目(10K)。以并列第一作者身份实现了《Nature》、《Science》、《Cell》三大顶尖学术期刊的“个人大满贯”。 
以下展示部分发表文章:
1. Yi X,Liang Y,Huerta-Sanchez E,#Jin X,…, et al. Sequencing of 50 Human Exomes Reveals Adaptation to High Altitude.Science(2010)vol.329(5987)pp.75-78
2. Michaelson J,Shi Y,Gujral M,Zheng H,Malhotra D,#Jin X,...,et al.Whole-Genome Sequencing in Autism Identifies Hot Spots for De Novo Germline Mutation.Cell(2012)vol.151(7)pp.1431-1442
3. Jiang Y, Yuen RKC, #Jin X, Wang M, … , et al. Detection of clinically relevant geneticvariants in autism spectrum disorder by whole-genome sequencing. The American Journal of Human Genetics (2013) vol. 93 (2) pp. 249–263


范广益:华大基因资深信息分析工程师, 2010年毕业哈尔滨医科大学生物信息学专业毕业后进入BGI,澳门大学在读博士;现负责华大基因研究院动植物基因组国际和国内大项目。共发表论文14篇,其中Science 2篇,Nature Genetics 2篇(第一作者2篇),Nature Biotechnology 2篇(第一作者1篇),Nature Communication 4篇(第一作者1篇)。

以下展示部分发表文章:
1. Lamichhaney S, Fan G, *, et al. Structural genomic changes underlie alternative reproductive strategies in the ruff (Philomachus pugnax). Nat Genet. 2015 Nov 16.  
2. Li F, Fan G, *, et al. Genome sequence of cultivated Upland cotton (Gossypium hirsutum TM-1) provides insights into genome evolution. Nat Biotechnol. 2015 May.
3. Chalhoub B, …*, Fan G, *, et al. Plant genetics. Early allopolyploid evolution in the post-Neolithic Brassica napus oilseed genome. Science. 2014 Aug 22.

许春艳:华大基因资深信息分析工程师,2010年毕业哈尔滨医科大学,生物信息学专业, 毕业后加入BGI;2015年毕业于香港中文大学,生物信息与基因组学院;现主要负责华大股份植物基因大项目的分析。熟练基因组组装,注释,进化,转录组分析的原理和方法,掌握动植物基因组的各种生物信息学分析方法和软件工具;了解个体重测序,甲基化方法原理;参与共发表的基因组论文5篇。
以下展示部分发表文章:
1. Draft genome sequence of chickpea (Cicer arietinum) provides a resource for trait improvement. Nature Biotechnology, January 2013.
2. Genome sequencing of the high oil crop sesame provides insight into oil biosynthesis. Genome Biology, February 2014.
3. Identification of a Novel Salt Tolerance Gene in Wild Soybean by Whole-Genome Sequencing. Nature Communications, July 2014.


【注意事项】 
1、请您在开班前将您的详细培训需求反馈给我们,以保证本次培训能更好的满足您的需求。 
2、请您携带自己的手提电脑,以便能将相关软件拷回使用。 
3、本次课程限定名额30名,为确保培训资源得到最佳利用,请尽快申请报名参加。 
4、已经成功付款的学员,如在2017年3月1日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3 个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。 
5、撤销席位后,学员可提交延期申请,参加 2017年3月 - 2017年9月期间由深圳市华大基因学院举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担。 


【联系方式】 
1、联系电话:0755-36352044 对外培训组(咨询时间:周一至周五9:00-12:00 14:00-18:00) 

2、E-mail:training@service.genomics.cn 

3、报名链接:https://www.wenjuan.com/s/FZfaEn/

4、如有任何疑问请发邮件至training@service.genomics.cn 或 留言。