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2016年10月生物信息分析工程师认证

复杂疾病专题面授培训班


地点:深圳      时间:2016.10.24-10.28



  各种复杂疾病在群体中的患病率常超过1%,许多人类常见病,以内分泌代谢病为例,如1型及2型糖尿病、血脂紊乱、肥胖、骨质酥松、自身免疫性甲状腺病均属复杂疾病范畴,成为当前危害人类健康,致丧致残的最主要的原因。而由于复杂疾病的发病因素涉及到多个基因且有环境因素复杂的参与情况及相互作用,因此复杂疾病的研究长期以来成为研究中的难题。

  随着高通量测序技术及基因组学的迅速发展,使得从基因组水平、转录组水平、表观遗传学等角度对疾病展开全方位、多层次的研究成为可能。而伴随着以基因组科技为核心的基因诊断、治疗等领域的高速发展,市场上对于生物信息从业人员的需求呈现急剧增长的态势。

  为了培养更多更专业的生物信息分析专业人员以适应市场的需求,被坊间戏称为“组学界黄埔军校”的华大基因组建其旗下生物信息分析专家团队,共同设立了华大生物信息分析专业认证培训体系。初级生物信息分析员认证培训体系已于2015年度搭建完成,备受期待的生物信息分析工程师认证培训也于2016年度正式拉开帷幕。上半年,我们圆满完成了微生物与癌症方向的分析工程师认证培训面授课程,更加受到关注的复杂疾病方向的认证培训课程也将在10月呈现给大家。


【生物信息分析工程师认证简介】

华大基因生物信息专业能力认证由低到高分为:生物信息分析员、生物信息分析工程师两个级别。生物信息分析工程师认证根据研究领域分为动植物、复杂疾病、微生物和癌症四个方向。

 培训目标:

     华大生物信息认证培训致力于让学员掌握最新的生物信息分析方法和丰富的实战经验                   

     01) 为在校大学生和求职者,开辟一条新的职业发展通道

     02) 为致力于从事生物信息分析的求职者,提供业界推崇的能力证明,增加就业机会

     03) 帮助生物信息分析从业者提高专业水平,增强职场竞争力

     04) 为科研工作者提供与同行一起探讨研究中的瓶颈问题,拓宽研究思路的机


认证流程:

生物信息分析工程师认证培训流程分为:远程在线课程+专题面授培训+中期项目实战(选修)+认证考试四个环节。学员可根据研究领域的不同选择一个或多个认证方向报名学习。

中期项目实战为选修环节,学员可根据自身情况选择性参与。完成其余3个必修环节,并通过认证考试,即可获得华大基因颁发的生物信息分析工程师认证证书。




【生信分析工程师认证——复杂疾病专题面授培训班】

培训优势:




主办单位:深圳市华大基因学院

举办地点:中国 深圳 

培训时间:2016年10月24日-10月28日


模块

时间

课程

时长

备注

远程课程

全年

生物信息分析工程师(复杂疾病)线上课程

附上链接:http://www.x-omics.org/

无限次观看

课程持续更新中

第一天

1.复杂疾病研究概述

1.1复杂疾病引言

什么是疾病?单基因疾病,复杂疾病,以及罕见病等相关概念

1.2测序技术在复杂疾病研究中的发展进程及研究前景

测序技术在复杂疾病研究的方法、动态;测序技术在复杂疾病研究中的应用

1小时

 

2.经典案例分享与项目讨论

常见、高发疾病、Meta

2小时

3.复杂疾病统计模型与分析方法

Linkage-analysis, case-control study, trios study, cross section study

2小时

4.单细胞技术在复杂疾病研究中的应用

4.1技术原理、方法&分析流程介绍

4.2应用案例

2小时

第二天

5.Linux及编程基础

5.1 Linux操作系统常用文件操作

5.2 Linux操作系统常用目录操作

5.3 Vi编辑器的使用

5.4 Linux操作系统安装软件

1.5小时

6 基于组学的复杂疾病分析思路——基因组学

6.1 复杂疾病相关基因组学项目研究策略与思路(目标区域,外显子测序,全基因组测序等)

6.2 数据分析原理、流程及常用软件使用方法

5.5小时

第三天

6.3 分析结果解读与运用

1.5小时

7 基于组学的复杂疾病分析思路——表观组学

7.1 表观组学研究技术在复杂疾病研究中的策略与思路(BS,RRBS,MBD,ChIP-seq等)

7.2 常用分析方法

5.5小时

第四天

8 基于组学的复杂疾病分析思路——转录组学

8.1 复杂疾病相关转录组研究策略与分析方法(定量分析、表达量计算、SNP检测、可变剪切分析&基因融合检测等)

7小时

第五天

8.2 常用技术原理与分析流程

3小时

 

9 基于组学的复杂疾病分析思路——宏基因组学

9.1 宏基因组学研究技术在复杂疾病研究中的策略与思路

9.2 常用分析流程

4小时

 

项目实战

可自主选择时间

生物信息分析工程师(复杂疾病)中期项目实战(可选)

10个工作日

 

线上考核

 

生物信息分析工程师(复杂疾病)认证考试

年底考试

 

【注】:深圳华大基因学院保留对以上课程信息(包括主题、课程安排和其他细节)进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准。


【收费标准】
注册费:

  • 生物信息分析工程师认证课程:打包优惠价6980元/人,包含专题面授培训班课程一次+生信分析工程师认证线上课程+生信分析工程师线上考核一次;
  • 生物信息分析员+生物信息分析工程师认证课程:打包优惠价7980元/人,包含专题面授培训班课程一次+生信分析员认证线上课程+生信分析工程师认证线上课程+生信分析员/生物信息分析工程师线上考核各一次;
  • 复杂疾病中期项目实战(选修):专家个性化辅导,经典项目全贯穿式实战培训。30000元/人,不参与任何优惠活动;
  • 复杂疾病专题面授培训班:6000元/人,含包括学费、资料费、上机费、其他材料费。
备注
  • 专题面授培训班培训期间可免费提供工作餐,可协助安排住宿,住宿费用自理。 
  • 特别说明:本次专题面授培训班限定名额35名,为确保培训资源得到最佳利用,请尽快申请报名参加。 
  • 参加完整的生物信息分析工程师(复杂疾病)认证课程并通过认证考核者颁发华大基因生物信息分析工程师(复杂疾病)认证证书。

【优惠政策】
  • 凡华大基因长期合作伙伴,可享受9.5折优惠。
  • 组团报名优惠:两人报名可享受9折、三人报名可享受8.5折、四人报名可另送一个免费名额。
(以上两项优惠不能同时使用,最终优惠解释权归华大基因所有!)

【专题面授培训培训对象】 

  1. 从事生命科学、生态学、医学检验、临床医学等领域科研工作者和高校教师及研究生 
  2. 致力于从事生物信息分析的在校大学生及求职者,或想提高生物信息分析专业技术水平的从业人员
  3. 通过华大生物信息分析员认证考试,想继续参加中级认证学习及考核的学员


【讲师团队】

我们的讲师团队由复杂疾病信息分析研究领域的专家及来自工作一线的技术主力共同组成,项目经验丰富,多次参与重大项目研究与论文撰写,具备开发生物信息学软件的宝贵实战经验,对生物信息学有全面了解和深刻认识。

金鑫:华大基因大数据研究科学家,参与并领导一系列重大科研项目如千人基因组计划、中丹糖尿病(LUCAMP),自闭症项目(10K)。以并列第一作者身份实现了《Nature》、《Science》、《Cell》三大顶尖学术期刊的“个人大满贯”。 
以下展示部分发表文章:
1. Yi X,Liang Y,Huerta-Sanchez E,#Jin X,…, et al. Sequencing of 50 Human Exomes Reveals Adaptation to High Altitude.Science(2010)vol.329(5987)pp.75-78
2. Michaelson J,Shi Y,Gujral M,Zheng H,Malhotra D,#Jin X,...,et al.Whole-Genome Sequencing in Autism Identifies Hot Spots for De Novo Germline Mutation.Cell(2012)vol.151(7)pp.1431-1442
3. Jiang Y, Yuen RKC, #Jin X, Wang M, … , et al. Detection of clinically relevant geneticvariants in autism spectrum disorder by whole-genome sequencing. The American Journal of Human Genetics (2013) vol. 93 (2) pp. 249–263
张涛:华大基因MHC(主要组织复合物)团队负责人,复杂疾病实验室负责人。主持参与多项相关重大项目如地中海贫血,银屑病等的研究。具有多年的复杂疾病项目研究与教学经验。
以下展示部分发表文章:
1. CaoH, WuJ, WangY, JiangH, ZhangT(*) et al. An Integrated Tool to Study MHC Region: Accurate SNV Detection and HLA Genes Typing in Human MHC Region Using Targeted High-Throughput Sequencing. Plos one.2013.
2. Zhou F, Cao H, Zuo X, Zhang T(*) et al. Deep sequencing of the MHC region in the Chinese population contributes to studies of complex disease. Nature Genetics. 2016.
3. Ryan, Daniele Merico, Hongzhi Cao...Tao Zhang… et al. Genome-wide characteristics of de novo mutations in autism. NPJ Genomic Medicine. 2016.
部分发明专利:
1. 陈仕平,李剑,张现东,甄贺富,陈彩芬,张涛,王俊,检测α珠蛋白基因拷贝数的方法和系统,申请日期:2012/8/6,授权日期:2014-9-24
吴逵:主要研究方向为单细胞基因组学技术、单细胞RNA-seq技术及其相关的生物信息学分析;癌症基因组研究、变异检测及生物学功能通路的分析与鉴定;华大基因学院特聘顾问及专职讲师,教学经验丰富
姚琼:主要研究方向为表观基因组测序数据的分析与研发。曾参与过二型糖尿病、白血病、结肠癌、肾癌、胃癌、双胞胎新生儿甲基化等项目的表观数据分析。目前主要做表观基因组测序的数据分析流程研发与升级,包括WGBS信息分析流程升级、TBS的产品研发以及单细胞BS产品研发。
1. Yi Huang,Sheng jie Gao, Song Wu , Qiong Yao,…, et al.Multilayered molecular profiling supported the monoclonal origin of metastatic renal cell carcinoma.Article first published online: 21 DEC 2013. DOI: 10.1002/ijc.28654
袁永娴:华大RNA方向研发负责人,主要研究方向为基因表达定量,可变剪接与融合基因的鉴定,长链非编码RNA的预测与功能分析,新平台与新技术在RNA方向的应用。 
1. Mou L, Zhang Q, Wang Y, et al. Identification of Ube2b as a novel target of androgen receptor in mouse sertolicells[J]. Biology of reproduction,2013: biolreprod. 112.103648. 
覃友文:华大科技研发部高级生物信息研发工程师。六年微生物研究经验,开发多套生物信息分析流程,曾参与华大基因的T2D(二型糖尿病)、CRC(结直肠癌)与人肠道微生物关联研究的大项目,教学经验丰富。
1. J Graessler, Y Qin, H Zhong, et al. Metagenomic sequencing of the human gut microbiome before and after bariatric surgery in obese patients with type 2 diabetes: correlation with inflammatory and metabolic parameters. The Pharmacogenomics Journal 13, 514–522; doi:10.1038/tpj.2012.43 (2013). (Co–first author)
2. Junjie Qin, …, Youwen Qin, ..., Jun Wang. A metagenome-wide association study of gut microbiota in type 2 diabetes. Nature 490, 55-60, doi:nature11450 [pii] 10.1038/nature11450 (2012).
3. Jun Yu, …, Youwen Qin, … , Jun Wang. Metagenomic analysis of fecal microbiome as a tool towards identification of targeted non-invasive biomarkers for colorectal cancer. Gut (2015)

【常见问题】 

1、本期培训班授课的软件分别有哪些? 

主要涉及的软件有比对软件bwa和hisat2,组装软件stringTie,去重软件picard,bam文件处理软件samtools,bam文件分析软件GATK,call突变软件muTect,以及显著突变基因寻找软件Mutsig等。 

2、课程内容是否包含相关论文写作的技巧? 

培训班的内容不包括论文写作的技巧,但会涉及到如何利用组学研究的结果进行数据挖掘和文章的设计。 

3、参加完本期培训是否可以达到独立进行数据分析能力? 

培训效果因学员自身专业背景不同而有区别,大部分学员基本可以掌握课堂所教授软件的用法。 

4、如何支付培训费?

可通过银行汇款、网上银行转账等方式支付培训费。

5、本期培训课程是否可以使用我自己的笔记本电脑?需要什么配置?

本期培训必须自备笔记本电脑,要求Windows XP 或Mac系统,CPU 2G以上,内存4G以上。


【注意事项】 
1、已经成功付款的学员,如在2016年10月10日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则仅退还80%的费用。

2、撤销席位后,学员可提交延期申请,参加2016年10月-2017年10月期间由深圳市华大基因学院举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担。


【报名方式】

1、联系电话:0755-36352044  黄老师 韩老师(咨询时间:周一至周五9:00-18:00)
2、E-mail:training@service.genomics.cn
3、网上报名:https://www.wenjuan.com/s/Ermeyq/