生物信息培训
生物信息培训 > 基本信息

生物信息学研讨系列转录组技能实操培训班


 为解决您在生物信息领域研究所遇到的问题,加快您的成果转化,华大基因特邀国内转录组研究领域系列文章一作及编程语言专家,为您带来一场转录组技能实操培训班!

 

【课程结构及内容】
1.以设计实例以及对实际问题的分析为引线,介绍转录组分析的各项知识要点;
2.学习及练习常用分析软件的使用方法,从而使学员深刻理解并掌握转录组分析的要点;
3.通过一个实际项目的演练,将课程各项知识点融会贯通,以达到真正掌握转录组分析的目的。
4.实践课占总课时70%以上,将技术学到手。

华大基因为学员提供windows系统能用的分析软件,请学员自带电脑。(电脑最好是windows系统,同时电脑需要连接有线网络端口,CPU 2G以上,内存4G以上)。


【培训特色】

1.一流的讲师团队——丰富的软件研发经验、重大项目执行经验

2.理论知识与项目设计相互结合,讲师授课与小组讨论共同进行

3.配合研究中所需的要点,围绕实际研究中常用的软件展开练习

4.从工作中的实际需要出发,精心挑选相应的上机实操软件,给您的研究带来最直接有效的帮助


主办单位:深圳市华大基因学院
举办地点:中国深圳
培训时间:2016年6月20日-2016年6月23日


【课程安排

时间

课程

时长

讲师

收费

星期一

RNA-seq进展及热点介绍;

1h

袁永娴

5600/

RNA-seq定量原理和方法介绍

2h

袁永娴

(包含数据过滤,质控,比对,定量,差异分析,GOpathway富集分析以及案例等)

上机实践:cluster聚类(1.5h);DAVID数据库(1.5h);KOBAS数据库(1.5h

4.5h

袁永娴

星期二

Linux操作基础

Linux操作系统的目录结构

Linux操作系统的目录结构

Vi编辑器的使用

3.5h

鞠佳

Perl 语言在生物信息学的基本应用

Perl的生物信息应用示例 ( DNA复制、DNA转录、RNA翻译、遗传漂变等的模拟、GC含量统计 、读写序列文件 )

生物信息模块:

解析常用数据库文件格式

程序从web下载文件

序列反转和翻译

获取motif上下游序列

统计分子量和密码子

转换blast格式

4h

鞠佳

星期三

denovo分析介绍

(没有参考基因/基因组物种分析策略和流程介绍以及案例)+trinity上机操作

3h

石明明

转录组重测序分析介绍

(有参考基因/基因组物种分析策略和流程介绍以及案例)+tophat上机操作

4h

石明明

星期四

RNA分析介绍 +长链非编码RNA分析介绍

3h

朱欠华

RNA预测软件以及靶基因预测软件介绍

转录组学项目设计经验分享以及经典案例介绍

4h

朱欠华

【注】:深圳华大基因学院保留对以上课程信息(包括主题、课程安排和其他细节)进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准。


【讲师团队】
我们的讲师来自工作一线,项目经验丰富,多次参与重大项目和论文撰写,有开发生物信息学软件的宝贵实战经验,对生物信息学有全面了解和深刻认识。每个专题主讲一人,老师配备助教,同时指导项目讨论及辅导实践上机。
华大基因学院专职讲师,培训经验丰富,责任心强,讲解细致,举一反三。
 

袁永娴老师,华大RNA方向研发负责人主要研究方向为基因表达定量,可变剪接与融合基因的鉴定,长链非编码RNA的预测与功能分析,新平台与新技术在RNA方向的应用。

1. Mou L, Zhang Q, Wang Y, et al. Identification of Ube2b as a novel target of androgen receptor in mouse
sertolicells[J]. Biology of reproduction,2013: biolreprod. 112.103648.

 

石明明,泛亚太疾病研究部,疾病研究方向

1.Zeng J, Liu Y, Liu W, Liu X, Liu F, Huang P, Zhu P, Chen J, Shi M, Guo F, Cheng P, Zeng J, Liao Y, Gong J, Zhang HM, Wang D, Guo AY, Xiong X. Integration of transcriptome, proteome and metabolism data reveals the alkaloids biosynthesis in Macleaya cordata and Macleaya microcarpa, PLoS One, 2013
2.JY Chen, Z Peng, R Zhang, XZ Yang, Bertrand CM Tan, CJ Liu, Y E. Zhang, Mingming Shi, ZQ Ye, X Zhang* and Chuan-Yun Li*, Functional RNA Editome in Rhesus Macaque Shaped by Adenosine Deamination and Purifying Selection, PLoS


朱欠华,高级项目负责人从事生物信息分析5年,主要擅于转录组和重测序分析,包括表达定量、非编码RNA调控、基因共表达网络以及变异检测等。参与多个合作项目(部分文章已发表),主要负责其中的信息分析工作。

1.Hao Q, Yadav R, …Zhu Q, et al. Transcriptome profiling of brown adipose tissue during cold exposure reveals extensive regulation of glucose metabolism. Am J Physiol Endocrinol Metab. 2015 Mar 1;308(5):E380-92

2.Guo L, Qiu J, …, Zhu Q, et al. A host plant genome (Zizania latifolia) after a century-long endophyte infection. Plant J. 2015 Aug;83(4):600-9

3.Li F, Xiao Y, …, Zhu Q, et al. Spatiotemporal-specific lncRNAs in the brain, colon, liver and lung of macaque during development. Mol Biosyst. 2015 Nov 10;11(12):3253-63


【课程对象】
1.从事RNA研究的工作者
2.迫切希望提升RNA信息分析能力的工作者


【收费标准】

1.注册费:5600/人(含学费、资料费、上机费、其他材料费);

2.培训期间可免费提供工作餐,可协助安排住宿,住宿费用自理。


【优惠政策】

1.凡华大基因生物信息学培训班老学员,可享受9.5折优惠;

2.4+1团体优惠,即同一单位有4人同时报名参加该期培训班,可额外赠送1个名额(只限于同一期培训班);

   以上优惠不能同时使用,最终优惠解释权归华大基因所有!


【注意事项】

1.已经成功付款的学员,如在201661日前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的注册费用。

2.因故不能如期参加本次培训班学员可提交延期申请,参加20166-201612月期间由深圳华大基因学院举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担。


【周边考察信息】

推荐自行前往的参观考察地点,详情请点击:《周边考察信息》


【问卷有奖】

为进一步完善现有华大基因学院培训课程体系,给大家呈现更优质的课程,现诚邀您对培训班进行评价(点击https://www.wenjuan.com/s/AjYZV3/),反馈的有效问卷即可获赠100元现金优惠券!

优惠券使用说明:

1、优惠券适用于华大基因学院开设的线上/线下的培训班和补考费。

2、优惠券有效期至2017年7月1日。

3、优惠券不可以与其他优惠券同时使用,最终优惠解释权归华大基因学院所有。


【联系方式】

1、联系电话:0755-36352044  对外培训组(咨询时间:周一至周五9:00-18:00)

2、联系邮箱:training@service.genomics.cn

3、报名链接:https://www.wenjuan.com/s/aQ7Z7j/