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生物信息学系列培训——疾病专题研讨班

组学技术的发展,开启了医学健康的新时代,测序技术已渗透到疾病研究的各个方向。中国精准医疗计划将在2015年下半年或明年启动。在2030年,中国精准医疗预计将要投入600亿元。组学技术开发与应用领域的领跑者——华大基因,在生育健康、复杂疾病、肿瘤个体化诊疗中都做出了开创性贡献,为将华大基因多年积累的宝贵经验,分享给各位同仁,华大基因倾情为您打造全面而实用的生物信息学精品课程——《生物信息学疾病专题研讨班》。

主办单位:深圳市华大基因学院

举办地点:中国 深圳

培训时间:2015518-522日(5天)

 

【培训目标】

Ø 系统了解疾病研究的新思路

Ø 全面掌握相关实验方法和信息分析技术

Ø 具备项目设计、数据分析、信息挖掘及报告解读的基本能力

 

【培训优势】

Ø 一流的讲师——丰富的科研经验、重大项目执行经验

Ø 全面的课程——理论知识、项目设计、分析方法&技术应用相互结合

Ø 经典的案例——《Nature》、《Science》、《Cell》系列经典文章

Ø 定制化服务——依据学员需求,定制化设计课程

Ø VIP增值服务——免费赠送生物信息类网络学习课程

Ø 面对面解决问题——与专家面对面探讨项目中的瓶颈问题

 

【重点内容】

Ø 前沿动态——系统介绍测序技术在疾病研究中的发展及研究前景

Ø 技术方法——贯穿DNARNA、表观遗传学、单细胞水平的实验和信息分析技术

Ø 案例解析 ——以华大经典科研成果为例,分方向介绍具体的设计思路和研究方案

Ø 实际应用——现场点评实际案例中具体问题(学员可自带问题&案例)

【课程内容】

开课时间

专题

课程内容

课时

讲师

授课形式

2015/5/18

必修

实验技术及信息分析方法

1.新一代测序技术在疾病研究中的发展进程及研究前景

1.1 测序技术的发展历程

1.2 测序技术在疾病研究的最新方法、动态

1.3 测序技术在疾病研究中的应用

3-4h

李奇斌

理论

2. 全基因组重测序&全外显子测序技术

2.1 在疾病分析中的研究思路及应用

2.2 高通量及芯片测序技术原理

2.3 数据分析原理、流程及常用软件使用方法

5h

施玉健

理论+上机

2015/5/19

3.  转录组测序技术

3.1  疾病相关转录组研究策略与分析方法

3.2  转录组相关测序技术原理及分析流程

3.3  定量分析、表达量计算、SNP检测、可变剪切分析&基因融合检测等常用信息分析方法

3.4 非编码RNA在疾病中的功能与研究方法
3.5 非编码RNA的预测,功能分析,靶基因鉴定
3.6 项目设计与案例分析

8h

袁永娴

理论+上机

2015/5/20

4.单细胞测序技术原理、方法&分析流程

3h

吴逵

理论

5.表观遗传学

5.1  在疾病分析中的研究思路

5.2  研究技术:BS(Bisulfite Sequencing),RRBS,MBD,ChIP-seq

5.3  常用信息分析方法

5h

姚琼

理论+上机

2015/5/21

选修一

单基因病、复杂疾病、Meta、肿瘤相关经典案例分享相关经典项目研究策略、总体设计和分析思路、遇到的困难及解决办法

6.单基因病经典案例分享

6.1 理论方法

6.2 案例讨论

6.3 上机实践

8h

张建国

理论+上机

2015/5/21

选修二

7.肿瘤研究经典案例分享

7.1 单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用

3h

吴逵

理论

7.2肿瘤基因组研究经典案例分享

4h

李祥春

理论

2015/5/22

选修三

8.复杂疾病经典案例分享               

3.5h

金鑫

理论

9.Meta经典案例分享               

4h

李俊桦

理论

【注】 :深圳市华大基因学院保留对以上课程信息(包括主题、课程安排和其他细节等)进行调整的权利,具体课程信息以实际上课为准。

 

【讲师团队】

 张建国:复旦大学生物信息学博士,深圳市高层次专业人才。先后参与了水稻、家蚕、家鸡、第一个亚洲人、玉米、西瓜等大型基因组计划。2003年荣获中国科学院杰出科技成就集体奖。2010年开始从事罕见遗传病研究工作,负责华大基因启动的千种单基因病合作研究计划。该计划已建立了基于新一代测序技术的致病基因发现分析流程,完成了5000例高质量样本的测序分析,发现了64个新的致病基因。迄今共发表SCI论文53,其中在ScienceNature及子刊发表文章8罕见病有关文章32

 金 鑫:华大基因遗传学研究科学家。主攻复杂疾病和群体遗传学方向,参与并领导一系列重大科研项目如千人基因组计划、中丹糖尿病(LUCAMP),自闭症项目(10K)。以并列第一作者身份实现了《Nature》、《Science》、《Cell》三大顶尖学术期刊的“个人大满贯”。

 吴 逵: 主要研究方向为单细胞基因组学技术、单细胞RNA-seq技术及其相关的生物信息学分析;癌症基因组研究、变异检测及生物学功能通路的分析与鉴定;华大基因学院特聘顾问及专职讲师,教学经验丰富

 

 李奇斌:中国科学院北京基因组研究所生物信息学博士。博士期间主要从事文昌鱼和家蚕microRNA基因的鉴定和表达研究,人类全基因组甲基化模式和遗传印记方面的研究工作。从2009年开始应用外显子测序进行复杂疾病的遗传学研究,开发相关统计方法和分析软件。

 1.Li Y, Zhu J, Tian G, Li N, Li Q, Ye M, Zheng H, Yu J, Wu H, Sun J, Zhang H, Chen Q, Luo R, Chen M, He Y,
Jin X, Zhang Q, Yu C, Zhou G, Sun J, Huang Y, Zheng H, Cao H, Zhou X, Guo S, Hu X, Li X, Kristiansen K, Bolund L, Xu J, et al.: The DNA methylome of human peripheral blood mononuclear cells. PLoS Biol  2010,8:e100053310.1371/journal.pbio.1000533.

 2.Liu S, Li D, Li Q, Zhao P, Xiang Z, Xia Q: MicroRNAs of Bombyx mori identified by Solexa sequencing. BMC Genomics 2010, 11:14810.1186/1471-2164-11-148.

 3.Chen X, Li Q, Wang J, Guo X, Jiang X, Ren Z, Weng C, Sun G, Wang X, Liu Y, Ma L, Chen J-Y, Wang J, Zen K,
Zhang J, Zhang C-Y: Identification and characterization of novel amphioxus microRNAs by Solexa sequencing. Genome
Biol
2009, 10:R7810.1186/gb-2009-10-7-r78.

 

 施玉健: 香港大学博士,主攻复杂疾病的关联分析(家系关联、群体关联),神经性疾病研究,异体移植瘤研究;擅长在于将算法应用于生物信息学。

 1.Jacob J.*,Yujian Shi*, et al. Whole Genome Sequencing in Autism Identifies Hotspots for De Novo Germline
Mutation.Cell. 2012.

  2.Williams F., Scollen S.,..,Yujian Shi, et al. Identification of rare variants contributing to pain
sensitivity:  an exome sequencing study. PLoS Genetics.2012.

 李祥春:华中科技大学生物信息学本科毕业,香港中文大学博士。2009年至今一直从事肿瘤基因组学的生物信息学研究工作。先后主要参与了食管癌、结直肠癌、胃癌、肺癌和乳腺癌等人类常见肿瘤的基因组分析和解读。

 1.Yongmei Song, Lin Li,.., Xiangchun Li, et al. Identification of genomic alterations in oesophageal squamous cell cancer. Nature 509, 91–95 (2014).

 2.Jun Yu, William K K Wu, Xiangchun Li , et al. Novel recurrently mutated genes and a prognostic mutation signature in colorectal cancer. Gut. 0,1–10 (2014).

 3.Yanan Cao, Minghui He, Xiangchun Li, et al. Activating Hotspot L205R Mutation in PRKACA and Adrenal Cushing's Syndrome. Science 344, 913-917 (2014).

 李俊桦:华南理工大学博士。2009年至今一直在华大基因研究院从事宏基因组学和生物信息学研究工作,参加并主导了数个宏基因组项目,主攻微生物信息分析软件开发,宏基因组分析,组装和功能注释。

 1.Nielsen, H. B. et al. Li J, et al. Identification and assembly of genomes and genetic

elements in complex metagenomic samples without using reference genomes. Nat. Biotechnol. advance on, (2014).

 2.Li J, Wang, J. Trends in metagenomic projects in China and Europe – what was learned from

the MetaHIT project, Experimental Medicine, Vol32-No.5 2014, P669-675. (In Japanese)

 3.Qin J, et al., Li J, et al. A metagenome-wide association study of gut microbiota in

type 2 diabetes, Nature, 2012 Sep doi:10.1038/nature11450

 袁永娴:华大基因RNA方向研发负责人。主要研究方向为基因表达定量,可变剪接与融合基因的鉴定,长链非编码RNA的预测与功能分析,新平台与新技术在RNA方向的应用。

 1.Mou L, Zhang Q, Wang Y, et al. Identification of Ube2b as a novel target of androgen  receptor in mouse sertoli
cells[J]. Biology of reproduction,2013: biolreprod. 112.103648.

 

【收费标准】

注册费:必修课5600/人,选修一2000/人,选修二2000/人,选修三2000/人(含包括学费、资料费、上机费、其他材料费及餐费)

培训期间可协助安排住宿,住宿费用自理。

【优惠政策】

Ø 华大基因长期合作伙伴可享有9.5折优惠。

Ø 组团报名优惠:两人同行可享受9折;三人报名可享受8.5折;四人报名可另送一个免费名额。

(以上两项优惠不能同时使用,最终优惠解释权归华大基因所有!)

【注意事项】

Ø 选修一选修二在同一天举行,不可同时选

Ø 已经成功付款的学员,如在2015425前联系主办方撤销席位,可退还100%的注册费用;如在开课前3个工作日内(含3个工作日)要求撤销席位则退还80%的费用。

Ø 撤销席位后,学员可提交延期申请,参加20155-201511月期间由深圳市华大基因学院举办的各类培训,费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款,退款期间产生的所有费用由学员本人承担。

【常见问题】

Ø 如何支付培训费?

可通过银行汇款、网上银行转账或在线支付等方式支付培训费。

Ø 培训后是否授予国家医学继续教育学分?

根据个人需要授予相应学分

Ø 培训后是否授予证书?

完成全部课程并通过考核者,由深圳华大基因学院统一颁发“生物信息学——疾病专题研讨班”结业证书。

【报名方式】

Ø 联系电话:0755-36352044 郑老师、王老师(咨询时间:周一至周五9:00-18:00

Ø E-mailtraining@service.genomics.cn